تهدف هيئة ال​​صحة العامة العمل على حماية وتحسين الصحة العامة للسكان بما يتماشى مع رؤية المملكة 2030 والتحول الصحي، وبوصفها منظومة معنية بالصحة العامة فإنها تهدف أيضاً إلى تحسين الصحة والوقاية من الأمراض، وتوفير معلومات الصحة العامة، لتحقيق الأمن الصحي، وتهيئة علوم المختبرات، وتخطيط القوى العاملة​​